Αν και τόσο τα MOC όσο και τα MOF περιέχουν μεταλλικούς-οργανικούς δεσμούς συντονισμού, υπάρχουν θεμελιώδεις διαφορές:
Διαστάσεις: Τα MOC είναι 0-διάστατα διακριτά μόρια, ενώ τα MOF είναι δίκτυα 2D ή 3D απείρως εκτεταμένα.
Διαλυτότητα: Τα περισσότερα MOC είναι διαλυτά, ενώ τα MOF είναι γενικά αδιάλυτα.
Σταθερότητα: Τα MOF γενικά έχουν υψηλότερη θερμική σταθερότητα.
Εστίαση εφαρμογής: Τα MOC υπερέχουν στη μοριακή αναγνώριση, ενώ τα MOF είναι πιο κατάλληλα για αποθήκευση αερίου.
